衡指所防疫升級，已規劃異地辦公開設第二指揮中心。資料照片
戰時為國家最高指揮中心的「國軍聯合作戰指揮中心（俗稱衡山指揮所）」與「國家政軍指揮中心」都是在大直圓山與雞南山的山洞中，並以隧道連接海軍司令部戰情中心。國防部為確保新冠病毒肺炎（COVID-19，俗武漢肺炎）無法入侵衡指所等作戰中心，除加強人員檢疫與定期消毒外，也規劃「異地辦公」開設第二指揮中心，以遂行指揮任務。
由於衡指所的所在地是仿美軍「北美防空司令部」指揮中心，是在山中開挖洞庫，洞庫門口並加裝防爆門，因此可抵擋核子攻擊的核震波及電磁脈衝；另外，衡指所在通風井中也加裝核生化防護裝置，還可抵擋核子污染、生化武器攻擊，等於是全世界最高等級的防護處所。
但為確保武漢肺炎以「人傳人」的方式，無法進行衡指所，癱瘓整個作戰指揮中心，國防部目前僅是以加強防疫進行管控人員進出，凡是體溫超過37.5度，即不准進入衡指所，並立即送醫檢查，以確保衡指所內部的人員安全。
國軍將領透露，國防部對於武漢肺炎疫情的變化，均有不同的備案措施，目前仍是以加強人員檢疫為主，但如果出現多家醫院的院內感染或社區感染，則會啟動更高的防疫措施，包括規範以7天為一週期的輪值，其他非輪值人員禁止出入衡指所等作戰中心，並採「分時作息、限地辦公」的方式，並每天執行3至4次的量測體溫，只要有一人體溫過高，即立即控管，其所限地辦公的官士兵也會進行隔離，確保不會傳染給其他組別人員。另外，國防部為確保指揮體系不中斷，除規劃異地辦公外，各級主官（管）已排定三級至五級的派代，並依防疫及作戰的標準作業程序立即啟動，確保國家安全指揮體系的遂行。（王烱華／台北報導）
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