行政院長賴清德12日宣布停建深澳電廠，讓行政院與新北市政府隔空交火連續五天。新北市府12日發佈新聞稿，否認賴清德質詢時的說法，引來行政院深夜出示會議資料反駁，新北市長朱立倫今再批執政黨「推卸責任，製造鬥爭」。行政院今發布新聞稿回應，指2010年時任行政院副院長的朱立倫主持的「行政院節能減碳推動委員會」會議裁示，符合追求全國性之節能減碳與減少空汙的方向，是相當正確且值得肯定的，「實在不應昨是今非，為了一時選舉，否定自己曾經做過的裁示」。
行政院指出， 賴揆12日已公開宣示停建深澳電廠，而新北市政府當天發布新聞稿指2010年朱立倫主持「行政院節能減碳推動委員會」會議，深澳電廠根本不在會議討論範圍，行政院基於釐清事實，才將會議簡報及相關裁示內容，據實呈現，讓社會瞭解。
行政院說，朱立倫13日於個人臉書，再度指出2010年所編列的深澳電廠更新經費3.8億元「只用在舊有機組的拆除」，也指稱深澳電廠是「早就廢棄的計畫」，但行政院必須再澄清深澳電廠更新案自始即為「先拆後建」計畫，拆除舊機組、舊廠房，是為持續穩定供電及減少空污目的，而要興建新機組、新廠房，所謂「早就廢棄的計畫」也非事實。
行政院解釋，此計畫不僅在2010年編列經費，2011年、2012年也編列相當經費持續推動，到2014年，因原規劃的卸煤碼頭位置（蕃仔澳）爭議未解，台電公司為避免財務損失，才向經濟部提出申請「緩辦二年」，而行政院2014年10月17日核定緩辦的相關公文上，亦載明「請經濟部督促台電公司於緩辦期間積極辦理卸煤碼頭替代方案評估，並持續對外溝通，解決卸煤碼頭興建問題。」
行政院接著說，由於電廠籌設許可已逾《環評法》所規定3年期限，因此同時請台電公司依法提出環差分析送環保署審查，這也是2016年10月緩辦二年期滿後，深澳電廠會再開始進行環差分析審查的由來，由上開公文書都足以充分證明深澳電廠更新案，在國民黨執政期間也都持續推動，計畫未曾廢止。
行政院指出，2010年「節能減碳推動委員會」的簡報內容與朱立倫當時的裁示、深澳電廠更新計畫，是跨越不同政黨執政所共同持續編列經費的，屬長期延續性的能源供應基礎建設，且該計畫在國民黨執政期間也確實未曾廢止，朱的發言與行政院基於歷史文件、事實根據所進行的相關說明，是就公共政策的理性討論，可受公評，他們也欣見朱與新北市府願意坦誠面對，肯認相關事實。
行政院表示，他們從不推諉責任，只有遇到外界有所誤解，即有責任還原事實真相，讓社會大眾清楚。行政院指出，深澳電廠更新是歷經國民黨與民進黨執政皆曾推動並支持過的計畫，一如觀塘天然氣第三接收站案及所有能源工程的規劃與執行，國家能源政策不論哪一黨執政都應致力推動，可惜如今因地方首長選舉而被刻意操作為政治議題，模糊原本能源轉型穩定供電兼顧減少空污的目的性。（鄭鴻達／台北報導）
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