（更新：增加爭議內容及網友意見）
2006年12月高雄市長選舉，陳菊以37萬9417票，得票率49.41%，僅以1114票險勝國民黨候選人黃俊英，正式入主高雄市長一職；2010年高雄市縣合併，陳菊再以82萬1089票、52.8%得票率，擊敗脫黨參選的前高縣長楊秋興與國民黨黃昭順，當選首任大高雄市長；2014年更以99萬3300票，68.09%超高得票率，再次擊敗對手楊秋興，連任大高雄市長，得票數更是該屆選舉中全國最高者。
陳菊三任高雄市長任內，因選舉得票數屢創新高，第三次得票比首次多出近62萬票，亦屢獲媒體評鑑民眾滿意度最高、五星市長等獎項肯定，奠定她南霸天地位，在黨內被視為「桶箍」重要角色，深受總統蔡英文敬重，對外必稱「菊姐」，如今入府擔任秘書長一職，繼續承擔改革重責，可謂政治生涯再攀高峰。
陳菊人氣居高不下，但其實12年任內也發生多次重大爭議，包括最早的當選無效官司。2006年12月首次選高雄市長險勝對手黃俊英1114票，陳菊陣營深夜召開記者會宣稱抓到對手有走路工賄選，事後黃俊英提當選無效及選舉無效等訴訟，歷經近1年審理才翻案，改判陳菊當選有效。
與中共關係陷冰點。2009年高雄電影節安排放映世界維吾爾代表大會主席熱比婭追求疆獨的紀錄片《愛的十個條件》，加上與南部7縣市首長聯合邀請達賴喇嘛來台為八八風災災民祈福，遭受中國打壓與抵制，引發觀光業和議會強烈反彈，當時她曾堅定說:「如果高雄市政府不敢播放這部片子，那麼我們就沒有立場。」強調「這是言論自由、信仰自由、這是人的基本價值」，但也因此與中國官方往來陷入冰凍期迄今。
颱風天在官邸睡覺。2010年9月19日凡那比颱風導致高雄淹水，當天下午陳菊被揭露不知去向，事後陳菊接受質詢時坦承回官邸「有睡覺」，兩名副市長也都各自回宿舍、參加喜宴，3人都未坐鎮防災指揮中心，事後市長辦公室主任還提供陳菊下午2時至5時視察市區不實訊息，遭依偽造文書罪判緩刑2年。
死傷慘重的石化氣爆。2014年7月31日深夜前鎮及苓雅區發生嚴重石化氣爆意外，造成32死、321人受傷，事後追查責任歸屬，高市府原稱意外發生是因不知情、沒有管線資料可查，但稍後證實捷運局輕軌會勘時就已知道榮化所屬管線埋設，陳菊為此出面道歉坦承市府橫向聯繫疏失，氣爆意外造也成陳菊任內最難以抹滅的痛。
強拆大型舊建設違反居住正義。2016年10月17日，包括高雄市公督盟、三民果菜市場自救會、前鎮第一公有市場自救會、舊左營國中拆遷自救會、蓮池潭居住正義自救會、中央公園護地護樹聯盟、正勤路與第五船渠自救會、守護茄萣濕地青年聯盟、路竹反台一線拓寬自救會等團體，對市府接連多處的執行強拆作為感到不滿，集結拉布條抗議，怒批陳菊違反居住正義、環境正義及程序正義。陳菊回應是以最大多數人最大利益為政策考量，被攻擊或責備她願意承擔。
愛將海洋局長王端仁下台。2017年11月14日，國民黨立委馬文君根據爆料錄音指高市府海洋局長王端仁，和漁業署官員會晤慶富造船副董陳偉志，由於時值慶富獵雷艦超貸案引發全國關注，王端仁在錄音中積極協助慶富取得興達港造船廠用地引發抨擊，遭質疑市府幫慶富護航，陳菊雖力挺王端仁操守，但仍以他招商用詞不當，同意他請辭接受調查。
背負舉債王惡名。陳菊在高雄主政12年，任內舉債增加約千億，市民平均負債高居各縣市之冠，背負「舉債王」惡名，儘管陳菊解釋是舉債建設，包括捷運、輕軌和鐵路地下化、治水等，並未亂花錢，且經市府持續嚴守財政紀律與控管開源節流，去年首度做到零舉債，並能實質還債10億元。
無力解決空污問題。高雄空汙問題嚴重，包括PM2.5紅害日高居六都之冠、左營測站更是全國超標日數最多的地區，也籌組南台灣反空汙大聯盟，每年遊行訴求要吸一口好空氣，環團亦屢到市府陳情抗議，舉牌抗議並嘲諷陳菊「一直睡、一直睡，不要睡覺了，趕快醒過來。」，要求她面對並有效處理空汙問題。
陳菊在高雄主政近12年，她在最近一次議會施政報告中細數任內重大政績，包括高捷紅橘兩線開通、舉辦被譽為史上最成功的世界運動會、設置C-Bike公共腳踏車租賃系統、公辦市地重劃、增加濕地、興建滯洪池改善淹水、推動產業轉型、打造亞洲新灣區、擴展駁二藝術文創、興建市總圖、爭取會展產業、設立1999市民服務專線等。
至於原規畫在陳菊今年底任期屆滿前，還有鐵路地下化後兩處廊道公園啟用、金獅雙湖公園、少康森林公園、十全滯洪池、岡山魚市場、旗山大溝頂、茄萣海岸線等工程。
網友在《蘋果》即時留言「把高雄搞到變小，負債變超大的陳菊，然後中間落跑」，不過也有網友給予正面鼓勵「高雄花媽，加油」。（周昭平／高雄報導）
發稿時間 00:34
更新時間 11:49
想知道更多，一定要看……
陳菊哽咽道別團隊首長 相約高雄街頭再遇
看了這則新聞的人，也看了……
花媽勸進蘇貞昌 扁力挺吳秉叡戰新北市
訂閱《蘋果》4大新聞信 完全免費
