民進黨全代會下午討論特赦前總統陳水扁案之際，陳水扁上午在總統直選與民主台灣研討會發表《內閣制未必不好》書面聲明，扁談到李登輝、他與馬英九、蔡英文四位民選總統寧願背負違背多數民意的罵名，被輿論批判不符黨政分際，成立府院黨黨團政策平台等「黑機關」。關鍵仍在憲政體制與民選總統之間的扞格，歷經20年的實際運作，已到非改弦易轍不可的地步。
陳水扁說，李登輝先擔任國民黨主席，再出任民選總統兼黨主席，他想當全民總統，不再兼任黨主席，後來被迫修改黨章落實黨政同步，由總統親兼黨主席。前總統馬英九擔任台北市長時就選上國民黨主席，並批評他總統兼黨主席違反黨政分際，馬當選後也有一段時間不兼黨主席，後來也不得不「扁規馬隨」，修改黨章由總統兼任黨主席。
陳水扁也提到蔡英文曾以在野黨主席身分批判馬英九兼任黨主席是黨政不分，等到她當選總統，還沒擔任總統就宣布520就職後仍將以總統身分兼任黨主席。
扁說，他是迄今唯一少數執政的總統，依據憲法增修條文提名行政院長，毋庸經過立法院的同意。閣揆雖然是最高行政首長，卻是民選總統的行政幕僚長或執行長，閣揆的權力來自總統的授權下放。透過國家安全會議召開，總統身兼主席除國防、外交與兩岸事務外，對國家重大變故的相 關事項都可以與聞唯獨對立法部門既是行政部門的監督制衡機關，又是民選總統重大選舉政見落實在法案、預算的權力分立合作不可少的支持力量，只能經由政黨運作來指揮協調黨團同志。
陳水扁分析，他的時代有府院黨黨團的政策協調平台九人小組會議，馬英九在野時的立院黨團批評那是沒有法源的黑機關，等到馬前總統上台，也有一個五人小組會議，「換湯不換藥」。蔡英文則有新九人的政策協調平台，爭議不休的一例一休決策，就是在第一次的新九人小組會議，由蔡總統親自拍板定案的。
他說，四位民選總統寧願背負違背多數民意的罵名，被輿論批判不符黨政分際或成立沒有法源的黑機關，也要總統兼任黨主席，同時成立府院黨黨團的九人或五人小組的政策協調平台，而且不分藍綠沒有例外。這中間涉及不少的問題，不是很難超越人性的總統節制權力所能解決，關鍵仍在憲政體制與民選總統之間的扞格，歷經20年的實際運作，已到非改弦易轍不可的地步。
陳水扁認為，總統兼黨主席亦非絕對，馬英九與他都曾經為了選舉失利辭掉黨 主席負起政治責任，另外選出新任的黨主席。
他說，民主政治是政黨政治，也是責任政治。但目前的憲政體制，總統有權卻不必向國會負責，行政院長則有責無權，完全違背有多少權力就要負起多少責任的民主真諦。有民意基礎的民選總統不可能沒有權力，除非修憲改成總統制，讓民選總統權責相符。台灣 20 年來的總統大選，不只國家不正常，選舉文化造成的社會紛亂也不正常。（王家俊／台北報導）
