繼前瞻計畫、北車防災中心後，台北市長柯文哲和交通部再掀新戰火，雙方為基隆輕軌應設置在何處意見相左，柯文哲質疑交通部規畫基隆輕軌在南港展覽館站，將破壞整體東區門戶計畫，並抱怨中央在過程中未做協調，但交通部日前反擊指已和北市轄下局處討論過。柯文哲今受訪再度火力全開，質疑不是講個話就叫做溝通，雙方講完沒結論就不叫溝通，柯並說若基隆輕軌連計畫都還在做可行性評估，那他要問交通部「你那個82億多預算是怎麼框出來的？」這就是最大的問題。交通部今再表示，基隆輕軌規畫階段均有與北市府討論，請柯市長抽空與同仁聊聊，另交通部也將與北市多溝通。
交通部今則表示，此刻正會同基隆市政府辦理基隆輕軌建設計畫可行性研究案，係考量在鐵路容量限制條件下，須同時兼顧基隆-台北間短途通勤旅客需求及往宜蘭、花東長程旅運需求，爰期透過基隆輕軌之建設，同時改善基隆南港間鐵路運輸瓶頸，並紓解花東列車一票難求之現象。
交通部表示，有關柯文哲市長質疑基隆輕軌應行駛至南港站而非南港展覽館站一節，交通部表示，目前鐵工局刻正辦理基隆輕軌可行性研究，因南港至汐止間軌道路廊空間不足，故現階段規劃以沿原有台鐵路廊進入台北市，並以南港展覽館為第一站。後續將與台北市政府協調，再研擬向市區延伸之可行方案，以結合東區門戶計畫之規劃，擴大基隆輕軌之服務範圍及效益。
另針對柯文哲質疑基隆輕軌影響東區門戶計畫，交通部表示，經查南港轉運站目前西站已經啟用，東站則預訂2022年啟用，所以未來基隆輕軌不論行駛至南港展覽館站或南港站，尚難掣肘目前南港轉運站之運作，且南港展覽館站可銜接捷運文湖線與板南線，亦可滿足基隆-台北間短途通勤旅客需求。
最後交通部表示，有關基隆輕軌建設計畫與基隆河谷開發案，於規劃階段均有跟台北市相關局處討論，台北市林欽榮副市長、捷運局張澤雄局長均有參與會議，請柯市長抽空與同仁聊聊。後續交通部將持續與台北市政府溝通及交換意見，俾利基隆輕軌建設推動符合北市要求。
交通部長賀陳旦今出席台灣美食展與柯文哲同台零互動，被媒體詢問該事，以及是否會尷尬，賀陳旦今皆避談不回應，僅對媒體詢問逛完美食展心得比出「雙讚」回應。(李姿慧／台北報導)
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