蔡總統昨臉書發文證實，嚴德發已向她自請處分，她告訴嚴，目前最重要是確保整體國軍防疫與疫調工作，用最高標準盡速進行；而在當前台海情勢下，國軍絕不能因為本案，影響國軍日常的戰力整備和國家安全的維護任務。國防部應坦誠面對問題，現階段國軍更應該積極強化防疫作為。
東海大學政治系教授沈有忠痛批，國人努力防疫，如今破口竟出現在國軍身上，這樣的懲處結果絕對無法安撫民心，畢竟此事不是政策錯誤而是嚴重隱匿疫情。即便嚴、劉稱已自請處分，但要處分到哪個程度都未說明，感覺就是被動自請處分，充分顯示他們肩膀不夠硬、只想止血，讓此事件暫時劃下一個句點。
海軍敦睦艦隊3月5日出發，3月12日抵達帛琉，執行完任務後在3月15日返航，並於4月9日抵達左營軍港。原回報3艘軍艦共744名官兵健康沒有問題，但4月18日卻驚傳3人武漢肺炎確診，19日再添21人，昨又添3例，總計確診人數27例。不但打破了台灣連續2天零確診的防疫狀況，確診官兵下船休假，足跡遍及全台12縣巿，疫情是否擴散，更是令人憂心。
立法院外交及國防委員會今邀嚴德發率海軍副司令梅家樹等人，針對「磐石軍艦染疫案及後續相關防疫處置」進行專案報告並備詢。國防部昨晚緊急舉行記者會，說明調查進度並宣布首波懲處名單，被認為有為今日委員會攻防先進行危機處理的意味。
嚴德發昨晚記者會一開始，就先率與會國防部高層官員在台上一鞠躬，對染疫事件造成社會不安向國人表達誠摯歉意。嚴接著說，他已向總統蔡英文自請處分，也因依蔡總統指示，對此事件誠實面對、徹底檢討，配合中央流行疫情指揮中心進行調查，也不會忘了捍衛國土的職責。
隨後，嚴德發也總結了初步調查，坦承有四大缺失。
1.疫情通報未落實
嚴德發說，敦睦支隊在遠航訓練期間，艦上醫官每天要向支隊長匯報艦上官兵健康狀況，支隊長再向海軍艦隊指揮部回報健康狀況。但據初步調查結果，航訓期間，共有5起發燒事件，支隊長並未向艦指部通報，疫情通報未落實。
2.聯檢小組未落實實際檢疫
敦睦支隊4月9日進到左營軍港，14日聯檢小組人員到3艘軍艦進行入境檢疫，包括查核全艦人員入境說明書、體溫健康狀況紀錄、航行期間人員就醫紀錄，但聯檢人員沒有檢視艦上人員就醫紀錄，沒有發現確有人員有發燒等武漢肺炎確診症狀。
3.任務執行防疫管理不確實
雖然這次出訪的友邦帛琉是武漢肺炎零確診，但支隊仍取消了當地民眾登艦參觀等活動。上岸後除官式拜會不戴口罩外，其他活動都要戴口罩。但在艦期間或訪問期間，部分官兵沒有全程戴口罩、保持安全距離，顯見防疫管理未落實。
4.防疫措施規劃不足
雖然訂有單位、個人疫情防範措施，但都是針對境內，沒有針對遠航任務訂防疫措施及作業程序。所以敦睦支隊回到左營港之前應適用的檢疫措施不夠明確。
嚴德發強調，據初步調查，海軍確未落實風險管理，未達防疫標準，傷害國軍形象，他與劉志斌自請處分，高嘉濱、陳道輝調離現職，未來事證到哪裡，懲處到哪裡。
面對外界究責，行政院昨展開危機處理，組「專案小組」因應今日委員會攻防。嚴德發昨下午先赴立院與民進黨團總召柯建銘會面；隨後前往政院報告，確定晚間開記者會。民進黨立院黨團定調今日委員會三方向，「要求國防部提出後續檢討」、「病毒是我們共同敵人，不是國防部」、「國防部應有具體檢討報告」。
針對首波懲處，前立委林郁方質疑，層級最高只到海軍艦隊指揮官，國防部長、參謀總長、海軍司令難道都沒責任嗎？明明疫情已很嚴重又有美國羅斯福號航母的前車之艦，當艦上已有人出現症狀，也都沒有人警覺？甚至還讓部分官兵提前下船放假？「這一連串的問題，讓外界擔心，軍紀是怎麼了？也顯示軍隊已散漫、糊塗，螺絲鬆了。」
前立委帥化民看到軍方懲處名單大罵「老套」，出事就找下面「頂鍋」，好比私菸案由中尉扛責，問題關鍵是誰下的命令，中將和少將做得了主嗎？沒有國安高層和三軍統帥同意，艦隊會急在此時出訪？
亞太防務雜誌總編輯鄭繼文認為，目前社會氛圍讓海軍像過街老鼠人人喊打，「很憂心此事成為洪仲丘事件翻版，把軍方打趴在地，不僅嚴重影響士氣，更不利台海安全。」
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