衛福部長陳時中說，台灣以Taipei名稱與會，是經多方權衡，畢竟「不是我方說了算」，在不矮化我方尊嚴下與會才是最重要的。指揮中心指出，因台灣與會專家簽署保密協定，內容不能公開，會中討論的相關議題，我國感染、防疫專家會仔細討論，做為往後制定防疫政策的參考依據。
據了解，昨首場會議中，各國專家針對武漢肺炎確診病例及防疫措施進行討論，我國專家並未發言，但仍收穫良多，主因是我國認為中國在病例診斷、防疫作為等多有隱匿，藉由專家會議可了解其他國家收治病例、防疫措施等詳細資訊，有高度參考價值。WHO祕書長譚德塞在開幕致辭時，呼籲各界分享病毒樣本，加速研發藥物與疫苗。
不願具名的感染症專家說，我國專家代表雖無機會發言，但相較日本、韓國、新加坡、泰國等確診病例較多的國家，台灣至今尚未出現社區疫情，所有確診病例也都找到感染源，我國防疫措施已做得相當好。至於今第二場會議，重點將是各國新藥及新疫苗開發情形，預計我國專家也將參與。
台灣疫苗推動協會理事長李秉穎醫師表示，以往WHO視訊會議都是討論大方向，不易討論到新藥、疫苗的研發細節，但台灣若藉此了解各國研發情形，對國內相關研發的參考會很有幫助。李指出，疫情爆發後各國積極研發新藥、疫苗，台灣絕不能單打獨鬥，透過參與視訊會議，也能尋找往後可合作研發的適當對象。
至於國內相關藥物使用或研發，國家衛生研究院感染症與疫苗研究所所長廖經綸說，會優先找尋曾用於SARS、MERS，且發現有良好效果的老藥新用，如泰國曾用抗愛滋藥物；也會找尋新藥，如美國使用的抗伊波拉藥物「瑞德西韋」，將試驗這些有潛力的藥物，盼能找到可緩和病情的藥物。
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