疫情指揮中心指揮官、衛福部長陳時中宣布，中國疫情險峻，如廣州已成半封城狀態，將針對中國航班加以限制，後天起所有旅客經中國、香港及澳門「轉機」入境台灣，一律居家檢疫14天。
居家檢疫者須留在家中或指定地點14天不得外出，不得出境或出國，里長或里幹事每天將關懷1至2次，有症狀者送醫，若未配合將強制安置，逕自外出者可開罰1萬至15萬元。
原本針對國人是要求從中港澳返台者，須居家檢疫14天，但自港澳轉機者不在此限。針對港澳人士已暫停受理申請臨時入境停留，已取得我有效入出境證件或居留證者仍可來台，須居家檢疫14天。針對住在中國各省市的中國籍人士，和14天內曾入境或居住中港澳的外籍人士，則已暫緩入境。
移民署統計，去年10月自港澳來台近11.7萬人次，11月約13.1萬人次，平均每月都有10幾萬人次港澳人士來台，但政府並未統計經港澳轉機人次；航空業界透露，飛中國、歐美等長途航線，可能不到2成旅客會經港澳轉機，實際數據待統計。
此外，後天起至4月29日，除往返北京首都機場、上海浦東及虹橋機場、廈門高崎機場、成都雙流機場的航點，其餘中國城市往返台灣的客運航班暫停飛航。陳時中呼籲，往來中港澳航班有非常多陸客，中國確診案例多、有社區感染，長時間跟很多陸客一起搭機有極高風險，非必要就勿搭飛機、勿去疫區，「我們這邊安全得很，不要一頭往疫區鑽，來增加自己風險」。
除了航空限制，海運也加嚴控管。陸委會昨宣布，金門、馬祖地方政府建議暫停小三通客船往來，基於防疫優先，考量目前在中國的金門、馬祖、澎湖鄉親返鄉需要，後天起暫停小三通，視疫情狀況再評估復航。
移民署初步統計本月1日至5日，金門小三通平均每日入境約425人次、馬祖28人次，主要為經小三通中轉的台人。
針對兩岸航線除北京、上海、廈門、成都5個機場外，其餘航點停飛，長榮航空回應，將配合防疫政策限縮直飛兩岸航班，後天起至4月29日，兩岸只保留往來北京、浦東、虹橋、廈門、成都的部分航班，其餘取消，會陸續公布航班取消訊息。中華、華信航空這段期間也僅提供5航點的部分航班，其餘皆暫時取消，華航官網已公告未來20天取消航班，下周起陸續公布其他資訊。
因應暫時關閉小三通，立榮航空後天起暫停金廈一條龍服務，恢復時間依政府公告與疫情狀況再決定，持有立榮金廈一條龍小三通套券的旅客，退票可免手續費。華信航空兩岸快易通也自同日起暫停服務，套券退票可免手續費，恢復時間待定。
另考量郵輪陸續出現確診案例，疫情指揮中心日前已宣布，國際郵輪屬人口密集、互動頻繁的高風險場域，即起禁止國際郵輪靠泊我國港口。台灣港務公司表示，已知到3月底前，停靠台灣的國際郵輪取消112艘次、影響約14.4萬名旅客。
統計國內至昨仍維持16例確診，除首例已出院，其餘持續住院隔離，另新增34例通報。
★維持16例確診：除首例外，餘15例持續住院隔離，病況穩定，接觸者共474人，其中15人有症狀已通報（10人已排除、5人檢驗中）
★新增34例通報：累計通報1369例，含16例確診、1232例排除、121例隔離檢驗中（52例初驗陰性、其餘待檢驗）
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