軍方昨早即由國防部總督察長黃國明，率特戰官兵及空軍嘉義聯隊、軍備局等共49人赴失事區域蒐證，並尋獲黑盒子。台北地檢署組成專案小組，昨兵分二路，由主任檢察官張智堯、檢察官蕭永昌前往失事地點勘驗、保全證據，另派主任檢察官沈念祖前往三軍總醫院，以證人身分就訊意識清楚的中將曹進平等傷者，希望盡快釐清墜機原因。
對於黑盒子判讀，運安會主委楊宏智說，運安會曾有調查黑鷹直升機經驗，也曾解讀過黑鷹直升機黑盒子，技術和人員都足夠；黑盒子有兩部分，包括語音和飛航紀錄，昨下午已收到黑盒子，由於沒有毀損、狀態良好，已完成資料下載。楊說，運安會昨加班作業，黑盒子資料今上午將送交國防部，內容待國防部公布。
楊宏智說，黑鷹直升機失事究竟是人員訓練問題，或是機件問題，亦也不排除有沒有遇到低空亂流問題，這些只要黑盒子資料解讀出爐，因有飛航紀錄且有錄音，黑盒子可以看出十之八九，大致輪廓就可以勾勒出來。
《軍事連線》雜誌主編陳維浩表示，黑盒子目前已經找到，待後續判讀，如果當時飛行員駕駛黑鷹的最後軌跡，沒有過山而撞山，就是天候因素；如果當時機上駕駛有試圖拯救飛機下墜姿態，屆時可以從黑盒子中看到高度與速度，就可能是機械問題。
陳維浩指出，從飛行員無線通訊到事故，是在一、兩分鐘內突然發生。就目前狀況來看，不管是天候變差，或機械突然發生嚴重事故，這兩種機會都非常低，讓人無法理解這次事故狀況，特別是搭載總長這種重要位階的軍方官員，不管是飛行員或戰管都會特別謹慎，如果有一點狀況就可能返航，但這些都沒有發生，是非常詭異情形。
他說，目前看到所有跡證並沒有主要造成事故的決定性因素，包括天候、機械或人為，無法很明確指證是哪一項因素導致。有一說雖然事故發生當日整體天候佳，駕駛進山前回報能見度好，但不排除過山區因低空雲霧狀況可能有比較大的變化，但也因為缺乏駕駛回報，而無法舉證。
陳維浩表示，飛行員完全沒有回報機械故障，隨後沒多久就發生事故，且墜毀看起來是往前衝的態勢，代表飛機可能已經在空中完全失控，旋翼失效無法提供浮力，但若失去動力還是可以利用旋翼剩餘浮力平緩降落，這是駕駛必備訓練，但從事故現場機頭整個撞爛，真的不太尋常。
國防部官員表示，「黑盒子」是飛航資料紀錄器、座艙語音紀錄器的統稱，其中記錄包括飛機飛行的速度、高度航向等重要資訊，因此成為判讀失事原因的重要依據，因此安裝的位置是在空難時最常被完整保留下來的機尾上。
空難瞬間發生時，黑盒子可以提供飛機失事瞬間和失事前一段時間，包括飛行狀況、機上設備、駕駛艙通話紀錄器等資訊，以便對事故作出正確的結論。
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