高院改判理由指出，徐耀昌准許外縣市廢土入境前，已函請苗縣府同意，經縣府指示依權責辦理後，函覆同意備查業者的進土申請案時，註記「視需要進土」而非「同意棄土」，也據實回覆台北市府工務局的查詢，未見違法之處，無從認定徐與所屬官員，明知且配合掮客販賣不實棄土證明文件牟利。
本案今年6月起進行二審辯論庭後，苗栗政壇一度傳出徐將在宣判前辭職，縣長依法改選，由徐妻蔡麗卿披掛上陣參選，歷經2個月辯論審理終結，昨改判徐耀昌無罪，不僅支持選民心情有如洗三溫暖般，也讓徐暫時度過停職危機。
本案源於1998年間，掮客包福碧、陳順勝等人經時任立委助理的彭省一協助，向頭份鎮公所申請免費提供棄土供垃圾掩埋場做覆土，企圖藉此販賣不實棄土證明，彭男靠私交請託徐耀昌促成，包男等人獲准進土，以每立方公尺150元到170元不等價格，出售8萬餘立方公尺的不實棄土證明給營建廠商，海撈1291萬餘元，檢方起訴24名官商與地主。
一審認定徐耀昌明知當時鎮內新舊垃圾場所需覆土自給自足，苗栗縣府也嚴禁外縣市棄土入境，徐仍指示部屬違法給予許可，雖無收賄證據，但徐有違職分，本案因審理逾8年未定讞，符合《速審法》減刑規定，一審依圖利罪判徐9年徒刑、褫奪公權6年，另17名被告各1年6月到13年不等，還有6人獲判無罪。
全案包括徐耀昌共19人上訴，高院昨判徐等8官員無罪，11名掮客各判拘役20天到6年不等；可上訴。
徐耀昌無罪的消息傳開，支持者賀喜電話不斷，徐耀昌說，20幾年來真的很煎熬，如今心中的大石頭終於放下來了，未來會好好的、認真的為苗栗盡心盡力來打拼，報答鄉親對他的關心。
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