去年由國民黨提案的公投「你是否同意政府維持禁止開放日本福島311核災相關地區，包括福島與周遭4縣市（茨城、櫪木、群馬、千葉）等地區農產品及食品進口」，獲779萬票同意，同意票比率約78％。
柯前天受訪指，歐美都已開放進口，「台灣有什麼理由和其他人不一樣？這種題目怎麼會上公投？」
綠色公民行動聯盟秘書長崔愫欣昨說，政治人物應在公投前闡述理念，而不是公投後放馬後砲，柯沒有善盡政治人物說清楚理念的責任，還在公投後用酸民的語氣來談，「這樣對政策有何意義？搞不懂他在想什麼。」
台灣食品安全促進協會理事長、台大毒理學研究所教授姜至剛認為，柯「弱智國家」的用詞很直白，沒有全錯但不是適當的語言，只會增加社會衝突；若依科學實證，想要重新思考日本核食禁止輸台政策，應先讓國人了解核食風險，再用適當的語言溝通，才能讓國人更加掌握核食議題。
主管機關衛福部回應，尊重核食公投結果，嚴格把關進口食品安全的立場不變，對柯文哲的看法並不了解，不做評論。
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