翁啟惠從2015年底就遭匿名黑函指控，涉嫌私下接受浩鼎董事長張念慈提供的技術股，當時翁和浩鼎接連聲明否認，去年3月，曾被翁形容為「窮畫家」的女兒翁郁琇，被爆曾是持有3000張股票的浩鼎前十大股東。
當時滯美未歸的翁啟惠被迫跨海發聲明解釋，女兒因心疼阿姨癌逝，所以利用父母捐贈的資金購股，支持浩鼎研發乳癌疫苗，而他只是聽營業員的建議、代為操盤，結果翁女又被爆在浩鼎新藥試驗解盲前後賣股，疑涉內線交易。
儘管翁對外聲明一變再變，檢調仍蒐證發現，翁啟惠的私人電郵中，早在2011年就和張念慈談妥，以1500張股票作為報酬，讓浩鼎取得研發新藥用的酵素合成技術，當時兩人並約定股票要掛在張的名下避嫌，而浩鼎內部「股權分配表」也記載，這筆股票的實際擁有者將為翁，雖這次行收賄未完成，但已構成期約行收賄。
後來兩人再次談好，以3000張股票換取中研院技術後，翁就在2012年以電子郵件向女兒詢問身分證字號，隨即用來開立證券帳戶，而張念慈則向浩鼎股東潤泰集團總裁尹衍樑借款，匯入翁女戶頭，偽裝成翁女自行付錢向潤泰購股的假象，最後再由張匯款美金321萬元（約1億元台幣）償還尹的借款，從頭到尾，翁沒出1毛錢就獲得股票，涉嫌行收賄。
但是浩鼎早知新藥試驗方法，不符主管機關的審查規定，且試驗數據未達可分析的條件，幾乎確定不可能通過新藥登記，浩鼎卻仍在2015年8月間的專家會議，決定要公布試驗解盲結果，張和總經理黃秀美等5高層並在隔年2月解盲前，陸續出脫持股躲損共約3500萬元。翁雖參加這場重大訊息成立的關鍵會議，但因他當時不知道試驗方式有問題，所以雖在解盲前賣股獲利600多萬元，不構成內線交易。
至於總統蔡英文胞兄蔡瀛陽曾被爆出，他和太太譚雯栩主導的「富鈦投資」曾是浩鼎第5大股東，當時民進黨表示，蔡英文擔任黨主席後，已出脫在潔生公司（富鈦前身）的持股。
而蔡瀛陽夫婦去年3月底也決定將富鈦的國內投資交由專業信託管理，並稱1年內出清浩鼎股票。檢方認為蔡家未參與專家會議，無從利用內線消息賣股。
藍委曾銘宗昨說，希望翁啟惠能勇敢面對，若真有冤枉，就讓司法還他清白。藍委吳志揚則認為，蔡英文家族投資生技產業，政府有必要說清楚背後的政商關係。綠委黃偉哲則說，「藍綠都該閉嘴了」，翁即使是很好的中研院長，若涉貪污，就讓司法去處理。
此外，尹衍樑被檢方認定，不知張念慈借錢的目的是買股行賄，因此全身而退。而衛福部健保署技正何小鳳曾被爆認購浩鼎19張股票，但檢方調查過程未發現不法。投保中心表示，會比照樂陞案，最快2月受理投資人登記啟動集體求償。
