海研二號是在進入日本沖繩波照間島南南西方海域時被日方驅離。時事通信社等日本媒體昨報導，日本海上保安本部表示，外國船隻須事先取得日本政府同意，才能在日本專屬經濟海域進行海洋調查，海研二號是二○一○年以來，首度未取得日本同意就在該海域內進行調查。
此項海洋調查計劃主持人、海洋大學教授龔國慶昨說，海研二號上周六凌晨從基隆出海，研究蘇拉颱風對台灣東部西北太平洋海域海洋生物和生態系統影響。船上人員透露，當時日方廣播要求海研二號離開，他們以廣播回應是在進行海洋調查，但日方仍要求離去，海研二號隨即停止調查並返航，昨晚抵達基隆碧砂漁港，提早一天回台。
龔國慶昨無奈說：「我們只是作學術調查也被趕，這不是第一次了。」只能秉持一貫處理原則：停止作業、離開。外交部解釋，海研二號所在位置，是在我方暫定執法線內，但日本海上保安廳也把波照間島海域劃在巡弋區內，導致兩國領海重疊，變成爭議海域。外交部亞東關係協會副祕書長蘇啟誠昨說，該海域是台日重疊海域，但海大是去作研究，仍在跟日方協調，希望能允許我方在此作業。
此外針對總統提出的「東海和平倡議」，日本放送協會（ＮＨＫ）、《日本經濟新聞》等日本媒體昨也都有報導。《產經新聞》駐台記者吉村剛史更撰文《跟著「領土」問題浮出的台灣微妙立場》，分析台灣人對釣魚台列嶼主權態度冷淡，且釣魚台主權紛爭恐妨礙日本和台灣重啟延宕多年的漁業談判。文中另指，台灣輿論向來「熱得快、冷得也快」，就連七月初台灣保釣人士的漁船大張旗鼓前進釣魚台，不但未獲台灣同胞相挺，反遭冷眼相待，因這釣人士帶的竟是中國五星旗。
而昨國防部記者會上，海軍司令董翔龍坦承馬總統要提出東海和平倡議前，並未徵詢他的意見。而對國防部作戰次長程士瑜多年前曾透露日本軍事實力大過於國軍，董說「打不過人家，難道就放棄嗎？」
★建造日期：1994年國科會出資建造，交由海洋大學管理
★噸位：294噸
★用途：進行海洋教學研究
★經歷：最遠到達中國長江口以北進行研究
★船上配備：全球衛星定位系統、海流儀、科學漁探儀、溫鹽深儀採水系統
資料來源：海洋大學教授龔國慶
●5/30：日本東京都知事石原慎太郎宣布要買釣魚台，放話已募款9億日圓 （約3億4000萬元台幣）
●7/05：台保釣人士前往釣魚台海域，海巡署護航與日海上保安廳船隻擦撞，保釣人士丟五星旗後離去
●7/11：中國在東海軍演，展示武力，暗示日本對釣魚台要節制
●7/14：中國漁政船3天內多次進入釣魚台海域
●7/20：日相野田佳彥說要將釣魚台收歸國有，支持日議員登島，祭祀二戰在該海域遇難的日本人民
●7/26：台灣海軍168艦隊演習時，越過演習線，逼近日本領海
●8/05早上：馬英九提出東海和平倡議，呼籲擱置主權，共享資源
●8/05下午：台灣海洋大學調查船進入沖繩領海，遭日船艦驅逐
資料來源：《蘋果》採訪整理
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