扁就像是大多數的被告，極不願待在僅1.86坪的舍房，陸續絕食三次，只是希望能夠獲得自由，他在《關不住的聲音》提及心境，「每次會見結束，看著賓客、親人、律師朝著陽光走去，我回頭向著陰森的牢房，步履越走越沉重，彷彿幾公斤的腳鐐拖著，走進黑獄套房，厚實的鐵門「叩」一聲，加兩道鎖，又回到人間煉獄。」
話雖如此，但扁在所內其實過得相當充實，除了開庭的時間，每天必做的功課就是看書、讀報、寫作、放風，扁辦秘書江志銘每天另固定安排黨政要員、親朋好友辦理接見，讓扁不僅不寂寞，還相當忙錄，扁還抽空在囚室內完成兩本熱門著作《台灣的十字架》、《關不住的聲音》。
由於天天會客，每天家人、親友送來2公斤會客菜，冬天贈厚襪、夏天備西裝，扁在北所內的生活硬是比別人優渥，像乾煎魚、滷牛肉，幾乎是每天都有，連他喜愛的烏魚子，也有友人準備。
有次扯掉立委邱毅假髮的黃永田帶烏魚子去看扁，扁吃了很感動，寫信給黃，「您帶著我最愛吃的烏魚子……我準備分一個禮拜，每餐二、三口，齒縫留香。」
即使過得比別人好，曾經貴為一國之尊的扁仍不滿意，時常放話。今年1月9日，北所例行性對孝一舍28號房進行安全檢查（俗稱抄房），扁就不爽指責：「怎麼亂動我的東西！」還誣指說用餐只有5分鐘、擦澡3分鐘，放風時間不夠，連開庭都不忘痛批北所醫師老、誤診，「關在裡面沒死是好加在，要死真的是猝死。」
而扁每次透過會見人員等方式對外放話後，所方就得發新聞澄清事實，搞得心力交瘁。此外，北所還怕扁在裡面遭到不同政治理念的人犯欺侮，將扁刻意和其他犯人隔開，保護得無微不至，讓扁獨居、放風一個人做運動，就連扁在走廊上走，也要淨空。
不僅如此，後來因扁放風被《蘋果》直擊拍到，所方擔心有維安漏洞，怕扁遭放槍狙殺，開始由轄區警員在扁放風時，進駐附近大樓製高點警戒，甚至還有人建議扁穿防彈衣，但遭扁拒絕，最後所方索性在放風場所的圍牆上架起帆布，阻隔外界視線。
雖然所方盡力維護扁的安全，但相關措施卻常被砲轟成禮遇，立委邱毅就曾經痛批：「看守所把他當皇帝來供養！」由於北所不論怎麼做，都有藍綠不同陣營批判，有管理員就感慨說：「阿扁想出去，我們比他更想讓他出去！」
06:50 廣播系統播放輕音樂，孝一舍主管叫編號早點名
07:10 盥洗，雜役打飯從「封口」遞餐
08:30 再次點名，隨後被管理員帶往忠、仁舍房間空地，或信、和舍房間空地，放風運動
09:00 管理員放水，扁在此時洗衣服
09:30 辦理接見、讀報、寫作，同時用耳機聽收音機，最常聽的節目為上午8~10時，由章天軍、阿生主持的《台灣人俱樂部》
11:30 發放親友寄送的衣物、食物
12:00 主管點名，雜役送餐。扁會將家人送來的食物拿出來配飯，打開掌上型電視看民視新聞
13:00 午休
13:30 在舍房內做伸展操，洗澡
14:00 放風運動
14:30 辦理接見、房內自由活動
17:00 晚餐
18:00 房內自由活動，閱讀、寫作
21:00 晚點名，寢室熄燈、睡覺
註：北所會不定時調整扁放風時間。
◎平常：
．滷肉飯、擔仔麵、台南小吃
．時令水果
◎看守所內：
．乾煎虱目魚、滷牛肉、烏魚子
．橘子、蘋果、小番茄、蜜棗
註：看守所內有寄送食物限制，且重量不得超過2公斤。
資料來源：《蘋果》採訪整理
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