本次選舉結果是民進黨近十年來最慘的敗仗，黨內批判聲四起，矛頭多指向陳水扁總統。學者表示，選舉結果將使陳總統嚴重跛腳，民進黨內派系問題將浮出檯面，內閣勢必改組，而馬英九幾可確定將代表泛藍問鼎2008總統大位。
昨天天氣晴朗，選民投票踴躍，中選員會統計，縣市長選舉的選舉人數是1364萬多人，總投票率66.22%，與上屆差不多。
上屆縣市長選舉23席中，國民黨和民進黨各9席、新黨1席、親民黨和無黨籍各2席。國民黨此役得到14席，包括台北縣、桃園縣、新竹縣市、苗栗縣、台中縣市、彰化縣、南投縣、嘉義市、基隆、宜蘭、花蓮縣、澎湖，增加5席。
其中北縣周錫瑋大贏羅文嘉近20萬票，奪回失去16年的執政權；宜蘭和嘉義市泛綠執政24年的「民主聖地」，分別由呂國華險勝回鍋參選的陳定南、黃敏惠擊敗由許家班轉投民進黨的陳麗貞，三大指標縣市「綠地變藍天」，意義重大，嘉市納入版圖，更讓國民黨跨過濁水溪。
民進黨這次只贏雲林縣、嘉義縣、台南縣市、高雄縣、屏東縣6席，萎縮了3席，空前慘敗。且羅文嘉、陳定南、林佳龍、邱太三4位政務官辭官參選，卻全軍覆沒，連阿扁故鄉台南縣都僅險勝1萬6千多票。
本次選舉其他3席，是以無黨籍身分參選的台東縣吳俊立、金門縣新黨李炷烽和連江縣親民黨陳雪生，3人都是藍軍。
昨天國民黨中央湧入大批支持者，隨著選情長紅，支持者情緒愈發興奮，當台北縣第14個勝選標誌貼出時，現場氣氛更沸騰。馬英九致詞時強調這次選舉是人民勝利，「國民黨沒有打敗民進黨，是民進黨打敗自己」。他並說：「從今晚開始，台灣的歷史將展開新的一頁，勝選是責任的開始、奮鬥的加強與面對挑戰勇氣的增加，國民黨不會因為贏而昏了頭，會用更大的動力與效率，把台灣全部贏回來，還給台灣人民！」榮譽黨主席連戰則高呼：「我們真正要努力的，是2008取得執政權！」
面對慘敗，民進黨中央黨部昨晚籠罩低氣壓，來自宜蘭的田媽媽確認宜蘭失守後，痛哭失聲，蘇貞昌、總統府秘書長游錫堃、行政院長謝長廷則向支持者三鞠躬表示感謝。蘇貞昌強調，這樣的選舉結果，是民進黨的重大挫敗，也是台灣人民給民進黨的警訊，民進黨應虛心接受，謙卑面對，誠實檢討，勇敢改革。陳總統則發表書面聲明，對選舉投開票平和順利完成表達欣慰。
針對選舉結果，台北大學公共行政系教授侯漢君分析，國民黨勝選最大原因是，民進黨對弊案處理不佳、採負面選舉策略，激發中間選民出來投票。輔大影像傳播系主任林維國則說，選舉結果顯示出選民已在凝聚「二次政黨輪替」氣氛。台大政治系教授葛永光認為，這次選舉是陳總統的「期中考」，而陳被「死當」，藍軍大勝對未來總統大選有很大影響，馬英九幾可確定將代表泛藍問鼎。
中國國台辦發言人李維一昨接受中央社訪問時說：「我們注意到這次選舉的結果，希望兩岸關係繼續朝和平穩定發展。」
在縣市議員部分，本屆應選901席，國民黨上次382席，這次當選408席；民進黨上屆147席，這次當選192席，都有成長；台聯上次7席，這次11席；親民黨上次49席，這次跌成31席；新黨上次3席，這次2席，另無黨籍256席。金門縣有1席因同票數，尚待抽籤決定。
鄉鎮市長選舉應選319席，國民黨上次195席，這次173席；民進黨上屆28席，這次35席；親民黨上次4席，這次3席；無黨107席；另無盟1席。縣市長當選人將於本月20日就職，縣市議員和鄉鎮市長當選人明年3月1日就職。
