為配合這項匯兌試辦，政府也同時放寬每人每次可攜帶入出境的人民幣數額上限，由現行的每人每次六千元人民幣增加為每人每次兩萬元人民幣。惟超額部分，海關仍將依規定沒入。不過由於兩岸尚未建立貨幣清算機制，因此目前仍不會全面開放兩岸貨幣兌換。
根據陸委會及中央銀行公布的施行辦法，目前可以辦理匯兌業務的金融機構包括金門地區的臺灣銀行、土地銀行、金門縣信合社，及馬祖地區的臺灣銀行分行。已提出申請的復華銀行，審查尚未完成，因此趕不及在十月三日開辦匯兌業務。未來也將陸續開放銀行委託商店、旅行社、旅館等代辦匯兌業務，不過官員強調，是否許可必須由中央銀行認定。
央行外匯局長周阿定說，此次開放是用「小三通」法源，只限於金馬設有戶籍六個月以上的國人、符合金馬「小三通」往來大陸地區，及大陸地區人民，才能進行兌換人民幣現鈔。
周阿定表示，兩種貨幣的兌換匯率由銀行依成本、業務量自行訂定，買賣匯價差也沒有限定，如昨天台幣兌美元收三三點二八二元，人民幣兌美元為八點零九三九元，透過美元間接計算，一塊人民幣約兌換四點一元台幣。
目前此六家金融機構都已委託第三地的外商銀行，如匯豐（HSBC）及美國銀行（BOA）進行買賣人民幣部位，且每天需彙報進出交易資料給央行，以便於掌控資金進出流量。
這項試辦業務的交易對象，除了設籍於金馬地區、經許可的台商企業員工等符合小三通資格的台灣人民外，為因應大陸人士到金馬觀光的需要，也將可利用試辦匯兌機制兌換台幣及人民幣。
不過，為了避免試辦成為洗錢、非法交易的管道，在兌換時必需出示護照、入台證的入出境查驗章或是往返的船票，並由金融機構加註結匯日期及金額。
民眾對於此項消息也都持正面看法，一位林姓民眾就說，小三通試辦近五年，兩岸往來愈來愈密切，金融匯兌是勢在必行，否則只會助長地下金融及偽鈔的橫行，損失的將是我方的民眾與台商。
剛由小三通自中國返回的馬祖民眾游建雄表示人民幣能在金馬流通，方便廠商貨幣的往來，更加活絡台商及兩岸人民的交流。
