佛光人文社會學院面臨沒有正式校長窘況。
潘岳攝
【高琇芬╱台北報導】龔鵬程因宗教因素去職，研究宗教與教育關係的南華大學社會學研究所助理教授林本炫認為：「若宗教辦學的董事會無法與校長互信，董事會依權責可解聘校長。」部分宗教團體創辦的大學則表示，董事會須避免捐款信徒干預校務行政。
林本炫說：「宗教辦學被賦予更高道德標準，董事會遴選出的校長必須肩負宗教教義。佛光是解聘龔鵬程的校長經營權，而非教職工作權，與學術自由沒有關連。」他表示，國內未曾發生講學自由與宗教教義相違背，導致失去工作權的行政訴訟案例。
華梵大學校長馬遜認為，董事會應與信徒保持適當的距離，以避免捐款的信徒干預校務行政，他說：「華梵創校時，曾有某企業家要『投資』三億元，但創辦人曉雲法師不願接受。」玄奘大學教務長林博文也說，曾有信徒想將丈夫近千萬元遺產捐出，但董事會婉拒。基督教長老教會創辦的真理大學校長葉明哲指出，該校董事會每三年改選一次，密集更換董事會成員可確保校務行政不受把持。
龔鵬程三年多前曾發表文章《論宗教大學的特色》，認為宗教團體辦大學並非「辦宗教大學」，應尊重大學的多元自主性。他在文中質疑：「學術自由很難與信仰不衝突，否則為何基督教創辦的大學只有校牧室而沒有禪堂？」
天主教創辦的輔仁大學校長李寧遠對此舉例，天主教主張不能墮胎，因此該校醫學院不研究人工生殖，也不宣揚使用保險套。李寧遠說：「輔大教職員接受聘任時，都要簽署遵守尊重生命的教義條款，過去曾有教師因墮胎而主動辭職。」
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