放在館外正門口3公尺高、13層的佛塔是海關博物館的鎮館之寶，裡面雕刻了300個佛僧，最初進口的人是以價值僅8266元的塑膠製品申請，想矇混入關，後來經過檢驗卻發現是由中國深海魚骨所精雕細琢而成。
除了最醒目的佛塔，海關博物館也展示許多讓人瞠目結舌的保育野生動物標本，有一整面牆擺滿了花豹皮、蛇皮、狐皮、山貂皮、蜥蜴皮等。
2006年海關查獲1228支象牙，重達5217公斤的象牙，比人手臂還粗，價值上百萬，可惜依規定須要銷毀，僅保留2支展示。
除這些難得一見的走私物之外，毒品一直都是查緝走私的主要業務，館內也展示了以前走私毒品的花招與藏毒物品，讓人大開眼界。
早期有毒犯將毒品藏在巧克力、洗髮精瓶罐、鞋墊等，比較特別的是曾有人將毒品藏在佛像中，認為海關一定不敢對佛像動手。
關務署公關科長陳金標回憶起當時他看到這尊佛像時，直覺有異，覺得佛像太過粗糙，且拿起來不像實心，感覺中間是空心的，於是大膽剖開，大不了弄錯理賠，敲破後果然如他所料，佛像中暗藏毒品。
海關博物館館長王雅茹：「走私區展示的高筒鞋墊藏海洛因，其實是海關人員意外發現。早年台灣很少有高筒鞋，海關人員看到高筒鞋很漂亮，問這4個人從國外那買回來的？毒犯作賊心虛面露異樣，海關馬上有警覺，請他們到辦公室閒聊，順便把鞋脫下來檢查，因此發現海洛因。」
海關博物館也展示有歷史的古文物，例如以毛筆寫字的公文、珠算盤、計算機、古董電腦等，2樓則展示各國海關的制服與貨幣。
海關博物館也是國內展示最多各國貨幣的博物館，王雅茹說，最大面額鈔票是南斯拉夫的貨幣5000億元，館內還展示了少見的蕭邦琴譜波蘭幣、希臘獅面人身像紙幣與紀念小王子50周年的法國紙鈔。
館長說，安哥拉也有面額百萬的紙幣，上面圖案是寫功課的小朋友，安哥拉雖然蘊藏豐富石油、鑽石，卻因為戰亂成為全世界最貧窮、發展最落後的國家之一，有很多戰死的娃娃兵，因此發行此紙幣，希望兒童能多讀點書強壯國力。
▍查緝走私區
◎象牙、花豹皮、蛇皮、狐皮、山貂皮、蜥蜴皮等
◎毒品、槍械、野生保育動物與仿冒品
◎鎮館之寶3尺高「魚骨佛塔」
◎2支犀牛角價值超過2000萬
▍通關作業文物
◎展示以前通關的文件、算盤、老電腦、關金券等
▍國際關務區
◎各國海關制服與貨幣
◎大面額紙鈔如5000億元的南斯拉夫貨幣、100萬的安哥拉紙幣
◎特殊紙幣如蕭邦琴譜的波蘭幣、希臘獅面人身像紙幣、紀念小王子50周年的法國紙鈔
▍海務燈塔區
◎展示燈塔與走私船艦模型
◎霧砲、透鏡、警示鐘等
▍參觀時間
◎周一~周五上午9時~下午5時須預約，參觀人數10人以上(不接受個人參觀)
資料來源：記者整理
