金融業盛傳，包括台銀、土銀、華銀、一銀等公股行庫高層，恐將在選後再掀一波大幅人事異動，其中第一金控董座張兆順、土銀董座吳繁治更因被外界認為屬於「親扁派」，公股大地震中恐成為首當其衝的對象。
熟知金融業人士指出，公營行庫董事長、總經理的任命案都是由財政部發布，惟實際決定權都在府院，財部則須負執行的責任。由於目前檯面上的公股高階經理人，除兆豐金董事長呂桔誠與總經理董瑞斌被視具謝系色彩外，各行庫主管並非長期親謝人士。市場選前即認為，無論哪一組總統候選人即位，公股人事勢必大搬風，如今馬英九大勝，未來新的財經內閣對行庫人事影響，更引人關注。
此外，一度喊停又重新啟動不到1年的二次金改政策，也將再重新檢討。據了解，一次金改耗費2500億元打消問題金融呆帳，二次金改還沒完成，泛公股金融機構因為大量釋股或推動整併，市值已經縮水832億元，相關政策持續推動成本偏高，新執政團隊恐吃不消。
財金官員指出，立院決議凍結公股金融機構釋股預算與人事，已先對金改踩煞車。至於民間金融機構整併公股金融機構部分，中信金21日公告2月份賣出兆豐金2979張，但市場人士透露，一旦藍營勝出，中信金釋股兆豐金只會純賣股，董事席次仍將留住1~2席。
而不論是只遵守金管會要求，在明年兆豐金董監改前，賣掉中信金直接持有的9.7%兆豐金股權，或一併釋出子公司中信銀持有兆豐金5%股權，中信金發言人吳一揆說，要看市況而定，而是否搭配董監席次共同轉讓，亦在研議中，尚無定案。
台企銀董事長蘇金豐亦表示，「二次金改雖曾考慮重新啟動，但因立院有不同聲音，兆豐金併台企銀的計劃案已擱置好一陣子。」金融人士指出，金管會站在加強金融競爭力的考量下，目前仍盼繼續推動二次金改策略，但如何說服立院與新閣揆，備受考驗。
到目前為止，兆豐金、台企銀雙方工會仍不贊同整併，蘇金豐指出，基於競爭力考量，已轉向尋找外資業務面的策略合作，在不涉及股權的前提下，讓台企銀可以迅速成長。
而幾已喊停的台新金、彰銀合併案，據彰銀民股透露，彰銀今年底將改選董監，吳東亮為守住8席董事，步步為營，近日頻拜訪大型券商，先將股務外包給大華證，確保委託書徵求，再與大券商簽約，有效掌控通路，「畢竟台新金能否確保續握過半席次，對台新未來推動換股合併案，深具重大影響」。
彰銀民股進一步分析，藍軍大選獲勝，對防堵台新併彰銀，算是「利多於弊」，藍軍想避免遭外界批評黑金復辟下，短中期來看，台新併彰銀時程可能放緩，但目前馬英九對二次金改態度尚不明確，這也是未來合併案的關鍵變數。
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